Durante a seca, nos campos extensos
cobertos predominantemente por
gramíneas e vegetação de cerrado, a
água chega a escassear, restringindo-se
aos rios perenes de leitos definidos,
às lagoas próximas a esses rios e a
alguns banhados em áreas mais rebaixadas
da planície. De novembro a março,
o Pantanal vive o período das cheias. A
vegetação muda segundo o tipo de solo e
de inundação, predominando espécies de
cerrado nas terras arenosas - conhecido
como Pantanal Alto - e gramíneas nas
terras argilosas, do Pantanal Baixo.

Com as cheias, as depressões são inundadas, formando extensos lagos, reconhecidos como Baías, de extrema beleza, principalmente se forem alcalinas, apresentando diferentes cores em suas águas, de acordo com as algas que ali se desenvolvem e criam matizes de verde, amarelo, azul, vermelho ou preto. Com a subida das águas, volumosa quantidade de matéria orgânica é carregada pela correnteza a grandes distâncias.Durante a vazante, esses detritos são depositados nas margens e praias de rios, lagoas e banhados, passando a se constituir em elementos fertilizantes do solo. Este verdadeiro patrimônio ecológico, habitado por incontáveis espécies de mamíferos e répteis, de aves e peixes, tem uma vegetação exuberante e é traduzido em movimento de formas, cores e sons , sendo um dos mais belos espetáculos da Terra.